ANALYSE FONCTIONNELLE DES PROTEINES

Responsable d’équipe :

Pr Eric CHABRIERE (eric.chabriere@univ-amu.fr)

Description :

La plateforme technique de chromatographie et spectrométrie de masse s’intègre dans la plateforme « Protéomique et analyse fonctionnelle des protéines »). Le personnel AP-HM travaille sous la direction de Pr Chabrière, .

L’équipe de chromatographie et spectrométrie de masse accompagne à la fois les biologistes de l’Hôpital et les chercheurs de l’IHU et développe son expertise suivant deux missions :

1. Le Diagnostic Clinique : identification de bactéries et organismes (Biotyping MALDI-TOF-MS) et dosage d’antibiotiques (UHPLC-UV).

2. Développement de méthodes :

– BIOTYPAGE : recherche de marqueurs correspondant à des maladies par MALDI-TOF-MS
– PROTEOMIQUE : identification de protéines en mélanges complexes, évaluation de l’expression des protéines (protéomique relative par label free), séquençage de novo de peptides.
– Petites molécules et métabolites : identification et dosage de petites molécules par chromatographie en phase liquide et gazeuse (gaz permanents, acides gras, acides amines, pesticides, antibiotiques, lipides…)

Equipements :

Biotypage :
– 8 MALDI-TOF-MS Microflex LT (Bruker 2010-2012)
– 1 MALDI-TOF-MS Autoflex Speed (Bruker 2016)
Protéomique :
– Robot FreedomEVO 100  (Tecan 2013)
– nanoAcquity 2D-LC (Waters 2013)
– spectromètre hybride Synapt G2Si (Waters 2013)
Petites molécules :
– UHPLC-UV/FLUO H-Class (Waters 2012)
– Headspace-GC/MS (Perkin Elmer 2013)
– GC-TCD (Perkin Elmer 2016)
– UHPLC-IMS-QTOF (iClass-Vion, Waters 2017)

Personnel AP-HM :

– ARMSTRONG Nicholas (nicholas.armstrong@univ-amu.fr), Ingénieur : petites molécules et métabolites (GC/MS, LC/MS et LC-UV/FLUO),

– COUDERC Carine (carine.couderc@univ-amu.fr), Ingénieur : Diagnostic et développements Biotyper (MALDI-TOF-MS)

– DECLOQUEMENT Philippe (philippe.decloquement@univ-amu.fr), Ingénieur: Protéomique (MALDI-TOF-MS et  LC/MS)

– PICAULT Luc (luc.picault@ap-hm.fr), Ingénieur : Diagnostic et développements Biotyper (MALDI-TOF-MS)

– RICHEZ/PHAM-VAN Magali (magali.richez@ap-hm.fr), Technicien : petites molécules (GC/MS, LC/MS et LC-UV/FLUO)

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